Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EDIL3O43854 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDIL3O43854 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EDIL3O43854 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
EDIL3O43854 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EDIL3O43854 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EDIL3O43854 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDIL3O43854 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDIL3O43854 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EDIL3O43854 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms