Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MAP3K13O43283 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MAP3K13O43283 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms