Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASKO14936 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASKO14936 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASKO14936 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms