Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOCS6O14544 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms