Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BHLHE40O14503 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms