Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EBAG9O00559 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EBAG9O00559 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms