Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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