Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PATL2C9JE40 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PATL2C9JE40 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms