Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WASHC1A8K0Z3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
WASHC1A8K0Z3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms