Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RNF222A6NCQ9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF222A6NCQ9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms