Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
E2F8A0AVK6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms