Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
FOXQ1Q9C009 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms