Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RBM42Q9BTD8 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RBM42Q9BTD8 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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