Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNB1Q02641 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms