Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR2-206ENST00000538035 5389 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01630-201ENST00000435144 5489 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLIT2-203ENST00000503837 4752 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA30-201ENST00000384028 129 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC12A1-203ENST00000396577 4708 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC33A1-202ENST00000392845 9217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 GAD1-217ENST00000625689 3700 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMA1-232ENST00000613205 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31D4-201ENST00000419782 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC28-208ENST00000612946 11274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PAN2-221ENST00000610546 5301 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms