Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC4A4-203ENST00000351898 3771 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP9-201ENST00000311277 7333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 USP40-203ENST00000427112 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ELF4-202ENST00000335997 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF6-202ENST00000287152 9082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC22-201ENST00000561890 6019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM1-203ENST00000537011 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC37A-201ENST00000320254 5177 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TENM2-203ENST00000518659 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CSF3R-203ENST00000373103 3454 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 GYG2-209ENST00000639373 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNVU1-7-201ENST00000383858 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL146P-201ENST00000472338 297 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-179P-201ENST00000516608 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NHLRC2-201ENST00000369301 11051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC7A2-204ENST00000494857 7622 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXHD1-212ENST00000582408 3755 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB40-202ENST00000375647 8685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms