Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GTF2H3Q13889 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms