Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
MKRN4PQ13434 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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MKRN4PQ13434 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
MKRN4PQ13434 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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