Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
HOXD11P31277 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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