Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LYVE1Q9Y5Y7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms