Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRXN3Q9Y4C0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRXN3Q9Y4C0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms