Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KIF3AQ9Y496 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KIF3AQ9Y496 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms