Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CHTOPQ9Y3Y2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms