Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UBE2J1Q9Y385 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms