Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM2AQ9Y2K7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM2AQ9Y2K7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms