Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POMPQ9Y244 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POMPQ9Y244 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms