Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNQ9UQP3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNQ9UQP3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms