Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SAMD4AQ9UPU9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms