Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCAF8Q9UPN6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCAF8Q9UPN6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms