Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENND2AQ9ULE3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENND2AQ9ULE3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms