Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ERG28Q9UKR5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ERG28Q9UKR5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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