Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MBD1Q9UIS9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MBD1Q9UIS9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms