Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SWAP70Q9UH65 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SWAP70Q9UH65 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms