Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CFDP1Q9UEE9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CFDP1Q9UEE9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms