Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LHX3Q9UBR4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LHX3Q9UBR4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms