Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP35Q9P2H5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP35Q9P2H5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
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