Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHPF2Q9P2E5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHPF2Q9P2E5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms