Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RDH8Q9NYR8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RDH8Q9NYR8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms