Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FAM53CQ9NYF3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FAM53CQ9NYF3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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