Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC10Q9NYD6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms