Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GDAP2Q9NXN4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDAP2Q9NXN4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms