Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CWC25Q9NXE8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms