Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MED9Q9NWA0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms