Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DEPPQ9NTK1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms