Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LTBP3Q9NS15 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LTBP3Q9NS15 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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