Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIN3Q9NQY0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIN3Q9NQY0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms