Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP13A2Q9NQ11 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms