Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB9BQ9NP90 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms