Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMEM27Q9HBJ8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms