Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPF2Q9HAU5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms